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import os
import json
import logging
import numpy as np
from typing import Dict, List, Optional, Tuple, Set
from dataclasses import dataclass
from pathlib import Path
import pickle
import re
from sentence_transformers import SentenceTransformer
import faiss
from langchain_openai import ChatOpenAI
from langchain.prompts import ChatPromptTemplate
# Réutiliser les classes du code existant
from template_db_creation import MedicalTemplateParser, TemplateInfo
@dataclass
class SectionMatch:
"""Représente le matching d'une section"""
section_name: str
confidence: float
extracted_content: str
can_fill: bool
missing_info: List[str]
@dataclass
class TemplateMatch:
"""Résultat détaillé du matching d'un template"""
template_id: str
template_info: TemplateInfo
overall_score: float
type_match_score: float
physician_match_score: float
center_match_score: float
content_match_score: float
filename_match_score: float # Nouveau score
fillability_score: float
section_matches: Dict[str, SectionMatch]
confidence_level: str
can_be_filled: bool
filling_percentage: float
missing_critical_info: List[str]
extracted_data: Dict[str, str]
filename_indicators: List[str] # Nouveau champ
@dataclass
class FilenameAnalysis:
"""Analyse d'un nom de fichier médical"""
original_filename: str
medical_keywords: List[str]
document_type_indicators: List[str]
specialty_indicators: List[str]
center_indicators: List[str]
anatomical_regions: List[str]
procedure_type: Optional[str]
confidence_score: float
class SmartTranscriptionMatcher:
"""Système intelligent de matching entre transcriptions et templates médicaux"""
def __init__(self, database_path: str = None):
"""Initialise le matcher avec une base de données existante"""
self.parser = MedicalTemplateParser()
self.llm = None
self.content_analyzer = None
self.section_extractor = None
self.filename_analyzer = None # Nouveau
self._initialize_gpt()
self._initialize_filename_keywords()
if database_path and os.path.exists(database_path):
self.load_database(database_path)
else:
logging.warning("Base de données non trouvée ou non spécifiée")
def _initialize_filename_keywords(self):
"""Initialise les mots-clés pour l'analyse des noms de fichiers"""
self.filename_keywords = {
# Types d'examens d'imagerie
"imagerie": {
"irm": ["irm", "mri", "resonance"],
"scanner": ["scanner", "tdm", "ct", "tomodensitometrie"],
"echographie": ["echo", "echographie", "doppler", "ultrasound"],
"radiologie": ["radio", "radiologie", "rx", "xray"],
"pet": ["pet", "tep", "scintigraphie"],
"mammographie": ["mammo", "mammographie", "breast"]
},
# Spécialités médicales
"specialites": {
"cardiologie": ["cardio", "coeur", "heart", "ecg", "holter"],
"neurologie": ["neuro", "brain", "cerveau", "eeg"],
"orthopedic": ["ortho", "os", "bone", "fracture"],
"gynecologie": ["gyneco", "utérus", "ovaire", "pelvien"],
"urologie": ["uro", "vessie", "rein", "prostate"],
"pneumologie": ["pneumo", "poumon", "thorax", "resp"],
"gastro": ["gastro", "abdomen", "foie", "intestin"]
},
# Régions anatomiques
"anatomie": {
"tete": ["tete", "crane", "cerebral", "encephale"],
"thorax": ["thorax", "poumon", "coeur", "mediastin"],
"abdomen": ["abdomen", "foie", "rate", "pancreas"],
"pelvis": ["pelvis", "pelvien", "utérus", "ovaire", "vessie"],
"membres": ["membre", "bras", "jambe", "genou", "epaule"],
"rachis": ["rachis", "colonne", "vertebral", "lombaire"]
},
# Types de procédures
"procedures": {
"arteriel": ["arteriel", "artere", "vasculaire"],
"veineux": ["veineux", "veine", "phlebo"],
"fonctionnel": ["fonctionnel", "dynamique", "stress"],
"contraste": ["contraste", "injection", "gadolinium"]
},
# Centres médicaux (à adapter selon votre contexte)
"centres": {
"roseraie": ["roseraie", "rose"],
"4villes": ["4villes", "quatre"],
"mstruk": ["mstruk", "struktur"],
"radioroseraie": ["radioroseraie"]
}
}
def _initialize_gpt(self):
"""Initialise GPT pour l'analyse de contenu"""
api_key = os.getenv('OPENAI_API_KEY')
if not api_key:
logging.warning("OPENAI_API_KEY non définie. L'analyse GPT ne sera pas disponible.")
return
try:
self.llm = ChatOpenAI(
model="gpt-4o",
temperature=0,
max_tokens=4000,
api_key=api_key
)
# Prompt pour analyser le contenu de la transcription
content_prompt = ChatPromptTemplate.from_messages([
("system", """Vous êtes un expert en analyse de transcriptions médicales. Analysez la transcription fournie et retournez UNIQUEMENT un JSON valide.
Votre tâche est de :
1. **Identifier le type de document précis** :
- "compte_rendu_imagerie" : IRM, scanner, échographie, radiologie
- "rapport_biologique" : analyses de laboratoire, résultats biologiques
- "lettre_medicale" : correspondance entre médecins, lettres de sortie
- "compte_rendu_consultation" : consultation médicale, examen clinique
- "rapport_operatoire" : comptes-rendus d'intervention chirurgicale
- "autre" : si aucun type ne correspond clairement
2. **Extraire les informations d'identification** :
- Médecin/praticien (nom complet si trouvé)
- Centre médical/hôpital/clinique
- Service médical
- Adresse et contacts si mentionnés
3. **Décomposer en sections structurées** :
- Identifier toutes les sections présentes (Technique, Résultats, Conclusion, etc.)
- Extraire le contenu complet de chaque section
- Identifier les sections manquantes mais attendues pour ce type de document
4. **Extraire les données médicales spécifiques** :
- Examens/procédures réalisés
- Mesures et valeurs numériques
- Diagnostics et observations
- Traitements ou recommandations
- Dates et références
5. **Évaluer la complétude** :
- Score de complétude (0-1)
- Informations manquantes importantes
- Qualité de la transcription
Retournez un JSON avec cette structure exacte :
{{
"document_type": "type identifié",
"identification": {{
"physician": "nom complet du médecin ou 'Non identifié'",
"center": "nom du centre médical ou 'Non identifié'",
"service": "service médical ou 'Non identifié'",
"address": "adresse complète si trouvée",
"phone": "numéro de téléphone si trouvé"
}},
"sections": {{
"nom_section": {{
"content": "contenu complet de la section",
"confidence": 0.9,
"keywords": ["mots", "clés", "identifiés"]
}}
}},
"medical_data": {{
"procedures": ["liste des procédures/examens"],
"measurements": ["mesures avec valeurs numériques"],
"diagnoses": ["diagnostics identifiés"],
"treatments": ["traitements mentionnés"],
"dates": ["dates importantes trouvées"],
"anatomical_regions": ["régions anatomiques concernées"]
}},
"completeness": {{
"score": 0.85,
"missing_sections": ["sections manquantes attendues"],
"missing_info": ["informations importantes manquantes"],
"transcription_quality": "excellent|good|fair|poor"
}},
"key_indicators": ["indicateurs clés pour le matching"]
}}"""),
("human", "Analysez cette transcription médicale :\n\n{transcription}")
])
# Prompt pour extraire le contenu d'une section spécifique
section_prompt = ChatPromptTemplate.from_messages([
("system", """Vous êtes un expert en extraction d'informations médicales.
On vous donne :
1. Une transcription médicale complète
2. Le nom d'une section spécifique à remplir dans un template
3. La description de ce qui est attendu dans cette section
Votre tâche est d'extraire UNIQUEMENT le contenu pertinent de la transcription pour remplir cette section du template.
Retournez UNIQUEMENT un JSON avec cette structure :
{{
"extracted_content": "contenu extrait pertinent pour cette section",
"confidence": 0.85,
"can_fill": true/false,
"missing_elements": ["éléments manquants pour compléter la section"],
"source_indicators": ["mots/phrases de la transcription qui justifient l'extraction"]
}}
Si aucun contenu pertinent n'est trouvé, retournez can_fill: false."""),
("human", """Transcription complète :
{transcription}
Section à remplir : {section_name}
Description attendue : {section_description}
Extrayez le contenu pertinent :""")
])
# Nouveau prompt pour analyser les noms de fichiers
filename_prompt = ChatPromptTemplate.from_messages([
("system", """Vous êtes un expert en analyse de noms de fichiers médicaux. Analysez le nom de fichier fourni et extrayez les informations médicales qu'il contient.
Retournez UNIQUEMENT un JSON avec cette structure :
{{
"medical_keywords": ["mots-clés médicaux identifiés"],
"document_type_indicators": ["indicateurs du type de document"],
"specialty_indicators": ["indicateurs de spécialité médicale"],
"center_indicators": ["indicateurs de centre médical"],
"anatomical_regions": ["régions anatomiques mentionnées"],
"procedure_type": "type de procédure principal ou null",
"confidence_score": 0.85
}}
Exemples d'analyse :
- "ECHOGRAPHIE" → document_type_indicators: ["echographie"]
- "ECHODOPPLER" → procedure_type: "echo-doppler"
- "ARTERIEL" → medical_keywords: ["arteriel"]
- "MEMBRES.SUPERIEURS" → anatomical_regions: ["membres supérieurs"]
- "radioroseraie" → center_indicators: ["roseraie"], specialty_indicators: ["radiologie"]"""),
("human", "Analysez ce nom de fichier médical : {filename}")
])
self.content_analyzer = content_prompt | self.llm
self.section_extractor = section_prompt | self.llm
self.filename_analyzer = filename_prompt | self.llm
logging.info("✅ GPT initialisé pour l'analyse intelligente avec noms de fichiers")
except Exception as e:
logging.error(f"❌ Erreur lors de l'initialisation GPT: {e}")
self.llm = None
def analyze_filename(self, filename: str) -> FilenameAnalysis:
"""Analyse le nom de fichier pour extraire des informations médicales"""
# Nettoyage du nom de fichier
clean_filename = os.path.basename(filename)
clean_filename = clean_filename.replace('.docx', '').replace('.doc', '').replace('.rtf', '')
# Analyse avec GPT si disponible
if self.filename_analyzer:
try:
response = self.filename_analyzer.invoke({"filename": clean_filename})
result = response.content.strip()
if result.startswith("```json"):
result = result[7:]
if result.endswith("```"):
result = result[:-3]
gpt_analysis = json.loads(result)
return FilenameAnalysis(
original_filename=filename,
medical_keywords=gpt_analysis.get("medical_keywords", []),
document_type_indicators=gpt_analysis.get("document_type_indicators", []),
specialty_indicators=gpt_analysis.get("specialty_indicators", []),
center_indicators=gpt_analysis.get("center_indicators", []),
anatomical_regions=gpt_analysis.get("anatomical_regions", []),
procedure_type=gpt_analysis.get("procedure_type"),
confidence_score=gpt_analysis.get("confidence_score", 0.0)
)
except Exception as e:
logging.warning(f"Erreur analyse GPT du nom de fichier: {e}")
# Analyse de fallback
return self._analyze_filename_fallback(filename)
def _analyze_filename_fallback(self, filename: str) -> FilenameAnalysis:
"""Analyse de fallback pour les noms de fichiers sans GPT"""
clean_filename = os.path.basename(filename).lower()
clean_filename = clean_filename.replace('.docx', '').replace('.doc', '').replace('.rtf', '')
medical_keywords = []
document_type_indicators = []
specialty_indicators = []
center_indicators = []
anatomical_regions = []
procedure_type = None
# Rechercher les mots-clés par catégorie
for category, subcategories in self.filename_keywords.items():
for subcat, keywords in subcategories.items():
for keyword in keywords:
if keyword in clean_filename:
if category == "imagerie":
document_type_indicators.append(subcat)
if subcat in ["echographie", "irm", "scanner"]:
procedure_type = subcat
elif category == "specialites":
specialty_indicators.append(subcat)
elif category == "anatomie":
anatomical_regions.append(subcat)
elif category == "centres":
center_indicators.append(subcat)
medical_keywords.append(keyword)
# Recherche de patterns spécifiques
patterns = {
"doppler": r"doppler|echo.*doppler",
"arteriel": r"arteriel|artere",
"veineux": r"veineux|veine",
"membres_superieurs": r"membre.*superieur|bras",
"membres_inferieurs": r"membre.*inferieur|jambe",
"pelvien": r"pelvi|utérus|ovaire",
"radiologie": r"radio"
}
for pattern_name, pattern in patterns.items():
if re.search(pattern, clean_filename):
if pattern_name == "doppler":
procedure_type = "echo-doppler"
elif pattern_name in ["arteriel", "veineux"]:
medical_keywords.append(pattern_name)
elif "membre" in pattern_name:
anatomical_regions.append(pattern_name.replace("_", " "))
elif pattern_name == "pelvien":
anatomical_regions.append("pelvis")
elif pattern_name == "radiologie":
specialty_indicators.append("radiologie")
# Calculer un score de confiance basé sur le nombre d'éléments trouvés
total_elements = len(medical_keywords) + len(document_type_indicators) + len(specialty_indicators)
confidence_score = min(1.0, total_elements / 5.0) # Normaliser sur 5 éléments max
return FilenameAnalysis(
original_filename=filename,
medical_keywords=medical_keywords,
document_type_indicators=document_type_indicators,
specialty_indicators=specialty_indicators,
center_indicators=center_indicators,
anatomical_regions=anatomical_regions,
procedure_type=procedure_type,
confidence_score=confidence_score
)
def calculate_filename_match_score(self, transcription_filename: str, transcription_analysis: Dict,
template_filename: str) -> Tuple[float, List[str]]:
"""Calcule le score de correspondance basé sur les noms de fichiers"""
# Analyser les deux noms de fichiers
trans_filename_analysis = self.analyze_filename(transcription_filename)
template_filename_analysis = self.analyze_filename(template_filename)
score_components = []
matching_indicators = []
# 1. Correspondance des types de documents
trans_types = set(trans_filename_analysis.document_type_indicators)
template_types = set(template_filename_analysis.document_type_indicators)
if trans_types & template_types:
type_match_score = len(trans_types & template_types) / max(len(trans_types | template_types), 1)
score_components.append(type_match_score * 0.4) # Poids important
matching_indicators.extend(list(trans_types & template_types))
# 2. Correspondance des spécialités
trans_specialties = set(trans_filename_analysis.specialty_indicators)
template_specialties = set(template_filename_analysis.specialty_indicators)
if trans_specialties & template_specialties:
specialty_match_score = len(trans_specialties & template_specialties) / max(len(trans_specialties | template_specialties), 1)
score_components.append(specialty_match_score * 0.25)
matching_indicators.extend(list(trans_specialties & template_specialties))
# 3. Correspondance des régions anatomiques
trans_anatomy = set(trans_filename_analysis.anatomical_regions)
template_anatomy = set(template_filename_analysis.anatomical_regions)
if trans_anatomy & template_anatomy:
anatomy_match_score = len(trans_anatomy & template_anatomy) / max(len(trans_anatomy | template_anatomy), 1)
score_components.append(anatomy_match_score * 0.2)
matching_indicators.extend(list(trans_anatomy & template_anatomy))
# 4. Correspondance des centres médicaux
trans_centers = set(trans_filename_analysis.center_indicators)
template_centers = set(template_filename_analysis.center_indicators)
if trans_centers & template_centers:
center_match_score = len(trans_centers & template_centers) / max(len(trans_centers | template_centers), 1)
score_components.append(center_match_score * 0.1)
matching_indicators.extend(list(trans_centers & template_centers))
# 5. Correspondance des types de procédures
if (trans_filename_analysis.procedure_type and
template_filename_analysis.procedure_type and
trans_filename_analysis.procedure_type == template_filename_analysis.procedure_type):
score_components.append(0.05)
matching_indicators.append(f"procédure: {trans_filename_analysis.procedure_type}")
# 6. Bonus pour correspondance de mots-clés généraux
trans_keywords = set(trans_filename_analysis.medical_keywords)
template_keywords = set(template_filename_analysis.medical_keywords)
common_keywords = trans_keywords & template_keywords
if common_keywords:
keyword_bonus = min(0.1, len(common_keywords) * 0.02)
score_components.append(keyword_bonus)
matching_indicators.extend(list(common_keywords))
# Score final
final_score = sum(score_components)
# Bonus si le nom de fichier de transcription contient "radiologie" et c'est cohérent
if ("radiologie" in transcription_filename.lower() and
any("radio" in indicator for indicator in matching_indicators)):
final_score += 0.05
matching_indicators.append("cohérence radiologie")
return min(1.0, final_score), matching_indicators
def load_database(self, filepath: str):
"""Charge la base de données vectorielle"""
self.parser.load_database(filepath)
logging.info(f"✅ Base de données chargée: {len(self.parser.templates)} templates")
def analyze_transcription_detailed(self, transcription: str, transcription_filename: str = "") -> Dict:
"""Analyse détaillée d'une transcription avec GPT, en incluant le nom de fichier"""
if not self.content_analyzer:
return self._fallback_analysis(transcription, transcription_filename)
try:
logging.info("🔍 Analyse détaillée de la transcription...")
# Inclure l'analyse du nom de fichier dans le contexte
enhanced_transcription = transcription
if transcription_filename:
enhanced_transcription = f"Nom de fichier: {transcription_filename}\n\nContenu:\n{transcription}"
response = self.content_analyzer.invoke({"transcription": enhanced_transcription})
result = response.content.strip()
# Nettoyer la réponse
if result.startswith("```json"):
result = result[7:]
if result.endswith("```"):
result = result[:-3]
result = result.strip()
analysis = json.loads(result)
# Ajouter l'analyse du nom de fichier
if transcription_filename:
filename_analysis = self.analyze_filename(transcription_filename)
analysis["filename_analysis"] = {
"medical_keywords": filename_analysis.medical_keywords,
"document_type_indicators": filename_analysis.document_type_indicators,
"specialty_indicators": filename_analysis.specialty_indicators,
"anatomical_regions": filename_analysis.anatomical_regions,
"procedure_type": filename_analysis.procedure_type
}
logging.info("✅ Analyse détaillée terminée")
return analysis
except Exception as e:
logging.error(f"❌ Erreur analyse détaillée: {e}")
return self._fallback_analysis(transcription, transcription_filename)
def _fallback_analysis(self, transcription: str, transcription_filename: str = "") -> Dict:
"""Analyse de fallback sans GPT"""
text_lower = transcription.lower()
# Détecter le type de document
document_types = {
"compte_rendu_imagerie": ["irm", "scanner", "échographie", "radiologie", "t1", "t2", "doppler"],
"rapport_biologique": ["laboratoire", "analyse", "biologie", "sang", "urine", "sérum"],
"lettre_medicale": ["lettre", "courrier", "correspondance", "cher confrère"],
"compte_rendu_consultation": ["consultation", "examen clinique", "patient", "antécédents"]
}
detected_type = "autre"
# Vérifier d'abord dans le nom de fichier
if transcription_filename:
filename_lower = transcription_filename.lower()
for doc_type, keywords in document_types.items():
if sum(1 for kw in keywords if kw in filename_lower) >= 1:
detected_type = doc_type
break
# Sinon vérifier dans le contenu
if detected_type == "autre":
for doc_type, keywords in document_types.items():
if sum(1 for kw in keywords if kw in text_lower) >= 2:
detected_type = doc_type
break
# Extraire les sections basiques
sections = {}
section_patterns = {
"technique": ["technique", "méthode", "protocole"],
"résultats": ["résultat", "observation", "constatation"],
"conclusion": ["conclusion", "diagnostic", "synthèse"]
}
for section, keywords in section_patterns.items():
for keyword in keywords:
if keyword in text_lower:
start = text_lower.find(keyword)
end = min(len(transcription), start + 500)
content = transcription[start:end]
sections[section] = {
"content": content,
"confidence": 0.6,
"keywords": [keyword]
}
break
analysis = {
"document_type": detected_type,
"identification": {
"physician": "Non identifié",
"center": "Non identifié",
"service": "Non identifié"
},
"sections": sections,
"medical_data": {
"procedures": [],
"measurements": re.findall(r'\d+\s*(?:mm|cm|ml)', transcription),
"diagnoses": [],
"treatments": []
},
"completeness": {
"score": 0.6,
"transcription_quality": "fair"
}
}
# Ajouter l'analyse du nom de fichier en fallback
if transcription_filename:
filename_analysis = self.analyze_filename(transcription_filename)
analysis["filename_analysis"] = {
"medical_keywords": filename_analysis.medical_keywords,
"document_type_indicators": filename_analysis.document_type_indicators,
"specialty_indicators": filename_analysis.specialty_indicators,
"anatomical_regions": filename_analysis.anatomical_regions,
"procedure_type": filename_analysis.procedure_type
}
return analysis
def calculate_type_match_score(self, transcription_analysis: Dict, template_info: TemplateInfo) -> float:
"""Calcule le score de correspondance du type de document"""
transcription_type = transcription_analysis.get("document_type", "")
template_type = template_info.type.lower()
# Mapping des types
type_mappings = {
"compte_rendu_imagerie": ["irm", "scanner", "échographie", "imagerie", "radiologie"],
"rapport_biologique": ["laboratoire", "biologie", "analyse"],
"lettre_medicale": ["lettre", "courrier", "correspondance"],
"compte_rendu_consultation": ["consultation", "examen"]
}
if transcription_type in type_mappings:
expected_keywords = type_mappings[transcription_type]
matches = sum(1 for kw in expected_keywords if kw in template_type)
return min(1.0, matches / len(expected_keywords) * 2)
return 0.3
def calculate_physician_match_score(self, transcription_analysis: Dict, template_info: TemplateInfo) -> float:
"""Calcule le score de correspondance du médecin"""
transcription_physician = transcription_analysis.get("identification", {}).get("physician", "")
template_physician = template_info.medecin
if not transcription_physician or transcription_physician == "Non identifié":
return 0.5
if not template_physician:
return 0.5
# Comparaison des noms
trans_words = set(transcription_physician.lower().split())
temp_words = set(template_physician.lower().split())
if trans_words & temp_words:
return 1.0
return 0.0
def calculate_center_match_score(self, transcription_analysis: Dict, template_info: TemplateInfo) -> float:
"""Calcule le score de correspondance du centre médical"""
transcription_center = transcription_analysis.get("identification", {}).get("center", "")
template_center = getattr(template_info, 'centre_medical', '') or getattr(template_info, 'center', '')
if not transcription_center or transcription_center == "Non identifié":
return 0.5
if not template_center:
return 0.5
# Comparaison des centres
if transcription_center.lower() in template_center.lower() or template_center.lower() in transcription_center.lower():
return 1.0
return 0.0
def calculate_section_matches(self, transcription: str, transcription_analysis: Dict, template_info: TemplateInfo) -> Dict[str, SectionMatch]:
"""Calcule les correspondances pour chaque section du template"""
section_matches = {}
transcription_sections = transcription_analysis.get("sections", {})
for section_name in template_info.detected_sections:
section_match = self._match_single_section(
section_name,
transcription,
transcription_sections,
template_info
)
section_matches[section_name] = section_match
return section_matches
def _match_single_section(self, section_name: str, transcription: str,
transcription_sections: Dict, template_info: TemplateInfo) -> SectionMatch:
"""Analyse le matching d'une section spécifique"""
section_lower = section_name.lower()
# Rechercher une section correspondante dans l'analyse
best_match_content = ""
best_confidence = 0.0
for analyzed_section, section_data in transcription_sections.items():
if isinstance(section_data, dict):
content = section_data.get("content", "")
confidence = section_data.get("confidence", 0.0)
# Vérifier la correspondance par mots-clés
section_keywords = section_lower.split()
analyzed_keywords = analyzed_section.lower().split()
keyword_match = len(set(section_keywords) & set(analyzed_keywords)) / max(len(section_keywords), 1)
if keyword_match > 0.3 and confidence > best_confidence:
best_match_content = content
best_confidence = confidence * keyword_match
# Si GPT est disponible, utiliser l'extraction spécialisée
if self.section_extractor and not best_match_content:
try:
section_description = f"Section {section_name} d'un document médical"
response = self.section_extractor.invoke({
"transcription": transcription,
"section_name": section_name,
"section_description": section_description
})
result = response.content.strip()
if result.startswith("```json"):
result = result[7:]
if result.endswith("```"):
result = result[:-3]
extraction_result = json.loads(result)
if extraction_result.get("can_fill", False):
best_match_content = extraction_result.get("extracted_content", "")
best_confidence = extraction_result.get("confidence", 0.0)
except Exception as e:
logging.warning(f"Erreur extraction section {section_name}: {e}")
# Évaluer si la section peut être remplie
can_fill = bool(best_match_content) and len(best_match_content.strip()) > 10
missing_info = [] if can_fill else [f"Contenu manquant pour {section_name}"]
return SectionMatch(
section_name=section_name,
confidence=best_confidence,
extracted_content=best_match_content,
can_fill=can_fill,
missing_info=missing_info
)
def calculate_fillability_score(self, section_matches: Dict[str, SectionMatch], template_info: TemplateInfo) -> Tuple[float, float, List[str]]:
"""Calcule le score de remplissage possible du template"""
total_sections = len(template_info.detected_sections)
fillable_sections = sum(1 for match in section_matches.values() if match.can_fill)
critical_sections = sum(1 for match in section_matches.values() if match.can_fill and match.confidence > 0.7)
if total_sections == 0:
return 0.0, 0.0, ["Template sans sections"]
fillability_score = fillable_sections / total_sections
filling_percentage = (critical_sections / total_sections) * 100
missing_critical = [
match.section_name for match in section_matches.values()
if not match.can_fill
]
return fillability_score, filling_percentage, missing_critical
def smart_match_transcription(self, transcription: str, transcription_filename: str = "", k: int = 10) -> List[TemplateMatch]:
"""Matching intelligent entre transcription et templates avec analyse des noms de fichiers"""
if not self.parser.templates:
logging.error("Aucun template chargé")
return []
logging.info("Analyse intelligente de la transcription...")
# 1. Analyser la transcription en détail (incluant le nom de fichier)
analysis = self.analyze_transcription_detailed(transcription, transcription_filename)
# 2. Pré-filtrer les templates par type et nom de fichier
candidate_templates = self._filter_templates_by_type_and_filename(analysis, transcription_filename)
if not candidate_templates:
logging.warning("Aucun template candidat trouvé, utilisation de tous les templates")
candidate_templates = list(self.parser.templates.keys())
logging.info(f"{len(candidate_templates)} templates candidats retenus")
# 3. Analyser chaque template candidat
template_matches = []
for template_id in candidate_templates:
template_info = self.parser.get_template_info(template_id)
if not template_info:
continue
# Calculer les scores de matching
type_score = self.calculate_type_match_score(analysis, template_info)
physician_score = self.calculate_physician_match_score(analysis, template_info)
center_score = self.calculate_center_match_score(analysis, template_info)
# Nouveau score basé sur les noms de fichiers
filename_score, filename_indicators = self.calculate_filename_match_score(
transcription_filename, analysis, template_info.filepath
)
# Analyser les correspondances de sections
section_matches = self.calculate_section_matches(transcription, analysis, template_info)
# Calculer le score de remplissage
fillability_score, filling_percentage, missing_critical = self.calculate_fillability_score(section_matches, template_info)
# Calculer le score de contenu (vectoriel)
content_score = self._calculate_content_similarity(transcription, template_id)
# Score global pondéré MODIFIÉ pour inclure le filename score
overall_score = (
type_score * 0.25 + # Type de document
fillability_score * 0.3 + # Capacité de remplissage
filename_score * 0.2 + # NOUVEAU: Score nom de fichier
content_score * 0.15 + # Similarité de contenu
physician_score * 0.05 + # Médecin
center_score * 0.05 # Centre médical
)
# Déterminer le niveau de confiance
confidence_level = self._determine_confidence_level(overall_score, fillability_score, analysis)
# Extraire les données pour le remplissage
extracted_data = self._extract_template_data(section_matches)
template_match = TemplateMatch(
template_id=template_id,
template_info=template_info,
overall_score=overall_score,
type_match_score=type_score,
physician_match_score=physician_score,
center_match_score=center_score,
content_match_score=content_score,
filename_match_score=filename_score, # Nouveau
fillability_score=fillability_score,
section_matches=section_matches,
confidence_level=confidence_level,
can_be_filled=fillability_score > 0.6,
filling_percentage=filling_percentage,
missing_critical_info=missing_critical,
extracted_data=extracted_data,
filename_indicators=filename_indicators # Nouveau
)
template_matches.append(template_match)
# 4. Trier par score global
template_matches.sort(key=lambda x: x.overall_score, reverse=True)
logging.info(f"{len(template_matches)} templates analysés")
return template_matches[:k]
def _filter_templates_by_type_and_filename(self, analysis: Dict, transcription_filename: str) -> List[str]:
"""Filtre les templates par type de document et nom de fichier"""
document_type = analysis.get("document_type", "")
filename_analysis = analysis.get("filename_analysis", {})
# Critères de filtrage élargis
filter_keywords = set()
# Ajouter les mots-clés du type de document
if document_type != "autre":
type_keywords = {
"compte_rendu_imagerie": ["irm", "scanner", "echo", "radio", "imagerie"],
"rapport_biologique": ["labo", "biologie", "analyse", "sang"],
"lettre_medicale": ["lettre", "courrier"],
"compte_rendu_consultation": ["consultation", "examen", "clinique"]
}
filter_keywords.update(type_keywords.get(document_type, []))
# Ajouter les mots-clés du nom de fichier
if filename_analysis:
filter_keywords.update(filename_analysis.get("medical_keywords", []))
filter_keywords.update(filename_analysis.get("document_type_indicators", []))
filter_keywords.update(filename_analysis.get("specialty_indicators", []))
# Si pas de critères spécifiques, retourner tous les templates
if not filter_keywords:
return list(self.parser.templates.keys())
# Filtrer les templates
matching_templates = []
for template_id, template_info in self.parser.templates.items():
template_filepath_lower = template_info.filepath.lower()
template_type_lower = template_info.type.lower()
# Vérifier les correspondances dans le nom de fichier du template
filename_matches = sum(1 for keyword in filter_keywords if keyword in template_filepath_lower)
type_matches = sum(1 for keyword in filter_keywords if keyword in template_type_lower)
# Prendre le template s'il y a au moins une correspondance
if filename_matches > 0 or type_matches > 0:
matching_templates.append(template_id)
return matching_templates if matching_templates else list(self.parser.templates.keys())
def _calculate_content_similarity(self, transcription: str, template_id: str) -> float:
"""Calcule la similarité de contenu via recherche vectorielle"""
try:
results = self.parser.search_similar_templates(transcription, k=50)
for tid, score in results:
if tid == template_id:
return score
return 0.0
except Exception as e:
logging.warning(f"Erreur similarité vectorielle: {e}")
return 0.0
def _determine_confidence_level(self, overall_score: float, fillability_score: float, analysis: Dict) -> str:
"""Détermine le niveau de confiance global"""
transcription_quality = analysis.get("completeness", {}).get("transcription_quality", "fair")
# Ajustement selon la qualité de transcription
quality_modifier = {
"excellent": 1.0,
"good": 0.9,
"fair": 0.8,
"poor": 0.6
}.get(transcription_quality, 0.8)
adjusted_score = overall_score * quality_modifier
if adjusted_score > 0.8 and fillability_score > 0.8:
return "excellent"
elif adjusted_score > 0.6 and fillability_score > 0.6:
return "good"
elif adjusted_score > 0.4 and fillability_score > 0.4:
return "fair"
else:
return "poor"
def _extract_template_data(self, section_matches: Dict[str, SectionMatch]) -> Dict[str, str]:
"""Extrait les données prêtes pour remplir le template"""
extracted_data = {}
for section_name, match in section_matches.items():
if match.can_fill and match.extracted_content:
# Nettoyer et formater le contenu
content = match.extracted_content.strip()
if content:
extracted_data[section_name] = content
return extracted_data
def print_smart_results(self, matches: List[TemplateMatch]):
"""Affichage détaillé des résultats de matching intelligent"""
if not matches:
print("Aucun résultat trouvé")
return
print(f"\n{'='*100}")
print(f"RÉSULTATS DE MATCHING INTELLIGENT - {len(matches)} templates analysés")
print(f"{'='*100}")
for i, match in enumerate(matches, 1):
print(f"\nTEMPLATE #{i}")
print(f"{'='*60}")
print(f"ID: {match.template_id}")
print(f"Score global: {match.overall_score:.3f}")
print(f"Confiance: {match.confidence_level}")
print(f"Template: {os.path.basename(match.template_info.filepath)}")
print(f"Médecin: {match.template_info.medecin}")
print(f"\nSCORES DÉTAILLÉS:")
print(f" • Type de document: {match.type_match_score:.3f}")
print(f" • Nom de fichier: {match.filename_match_score:.3f}") # Nouveau
print(f" • Médecin: {match.physician_match_score:.3f}")
print(f" • Centre: {match.center_match_score:.3f}")
print(f" • Contenu: {match.content_match_score:.3f}")
print(f" • Remplissage: {match.fillability_score:.3f}")
# Afficher les indicateurs du nom de fichier
if match.filename_indicators:
print(f"\nINDICATEURS NOM DE FICHIER:")
print(f" • Correspondances: {', '.join(match.filename_indicators)}")
print(f"\nCAPACITÉ DE REMPLISSAGE:")
print(f" • Peut être rempli: {'OUI' if match.can_be_filled else 'NON'}")
print(f" • Pourcentage: {match.filling_percentage:.1f}%")
if match.section_matches:
fillable = [s for s in match.section_matches.values() if s.can_fill]
missing = [s for s in match.section_matches.values() if not s.can_fill]
print(f" • Sections remplissables: {len(fillable)}/{len(match.section_matches)}")
if fillable:
print(f" • Remplissables: {', '.join([s.section_name for s in fillable])}")
if missing:
print(f" • Manquantes: {', '.join([s.section_name for s in missing])}")
if match.extracted_data:
print(f"\nDONNÉES EXTRAITES:")
for section, content in match.extracted_data.items():
preview = content[:100] + "..." if len(content) > 100 else content
print(f" • {section}: {preview}")
print(f"{'='*60}")
def get_best_fillable_match(self, transcription: str, transcription_filename: str = "") -> Optional[TemplateMatch]:
"""Retourne le meilleur template qui peut être effectivement rempli"""
matches = self.smart_match_transcription(transcription, transcription_filename, k=10)
# Filtrer uniquement les templates qui peuvent être remplis
fillable_matches = [m for m in matches if m.can_be_filled and m.fillability_score > 0.6]
return fillable_matches[0] if fillable_matches else None
def test_with_provided_example(self):
"""Teste le système avec l'exemple fourni par l'utilisateur"""
# Transcription d'exemple fournie
transcription_filename = "default.73.931915433.rtf_3650535_radiologie.doc"
transcription_content = """**Technique :** 3 plans T2, diffusion axiale, T2 grand champ et T1 Dixon.
**Résultats :**
* L'utérus est antéversé, antéfléchi, latéralisé à droite, de taille normale pour l'âge.
* L'endomètre est fin, mesurant moins de 2 mm.
* Pas d'adénomyose franche.
* Aspect normal du col utérin et du vagin.
* L'ovaire droit, en position postérieure, mesure 18 x 11 mm avec présence de 4 follicules.
* L'ovaire gauche, en position latéro-utérine, présente un volumineux endométriome de 45 mm, typique en hypersignal T1 Dixon.
* Deuxième endométriome accolé à l'ovaire droit, périphérique, mesurant 13 mm.
* Pas d'épaississement marqué du torus ni des ligaments utéro-sacrés.
* Pas d'autre localisation pelvienne.
* Pas d'épanchement pelvien.
* Pas d'anomalie de la vessie.
* Pas d'adénomégalie pelvienne, pas de dilatation des uretères.
**Conclusion :**
* Endométriome ovarien droit périphérique de 13 mm.
* Endométriome ovarien gauche centro-ovarien de 45 mm."""
print("ANALYSE DE L'EXEMPLE FOURNI")
print("="*80)
print(f"Nom de fichier: {transcription_filename}")
print(f"Contenu: {len(transcription_content.split())} mots")
# Analyser le nom de fichier
filename_analysis = self.analyze_filename(transcription_filename)
print(f"\nANALYSE DU NOM DE FICHIER:")
print(f"Mots-clés médicaux: {filename_analysis.medical_keywords}")
print(f"Indicateurs de type: {filename_analysis.document_type_indicators}")
print(f"Spécialités: {filename_analysis.specialty_indicators}")
print(f"Centres: {filename_analysis.center_indicators}")
print(f"Régions anatomiques: {filename_analysis.anatomical_regions}")
print(f"Type de procédure: {filename_analysis.procedure_type}")
print(f"Score de confiance: {filename_analysis.confidence_score:.3f}")
# Effectuer le matching
print(f"\nMATCHING EN COURS...")
results = self.smart_match_transcription(transcription_content, transcription_filename, k=5)
# Afficher les résultats
self.print_smart_results(results)
# Afficher le meilleur match
best_match = self.get_best_fillable_match(transcription_content, transcription_filename)
if best_match:
print(f"\nMEILLEUR TEMPLATE REMPLISSABLE:")
print(f"Template: {best_match.template_id}")
print(f"Score global: {best_match.overall_score:.3f}")
print(f"Score nom de fichier: {best_match.filename_match_score:.3f}")
print(f"Indicateurs nom de fichier: {', '.join(best_match.filename_indicators)}")
print(f"Capacité de remplissage: {best_match.filling_percentage:.1f}%")
def main():
"""Fonction principale pour tester le matching intelligent avec noms de fichiers"""
# Demander le chemin de la base de données
db_path = input("Chemin vers la base de données (templates/medical_templates.pkl): ").strip()
if not db_path:
db_path = "medical_templates.pkl"
if not os.path.exists(db_path):
print(f"Fichier de base de données non trouvé: {db_path}")
return
print(f"\nInitialisation du système de matching intelligent...")
# Initialiser le matcher
matcher = SmartTranscriptionMatcher(db_path)
# Options de test
print(f"\nOPTIONS DE TEST:")
print("1. Utiliser l'exemple fourni (radiologie)")
print("2. Saisie manuelle")
print("3. Lecture depuis fichier")
choice = input("\nChoisissez une option (1-3): ").strip()
if choice == "1":
# Utiliser l'exemple fourni par l'utilisateur
matcher.test_with_provided_example()
return
elif choice == "2":
# Saisie manuelle
transcription_filename = input("Nom du fichier de transcription: ").strip()
print("\nEntrez votre transcription (tapez 'FIN' sur une ligne vide pour terminer):")
lines = []
while True:
line = input()
if line.strip() == 'FIN':
break
lines.append(line)
transcription = '\n'.join(lines)
elif choice == "3":
# Lecture depuis fichier
filepath = input("Chemin vers le fichier de transcription: ").strip()
try:
with open(filepath, 'r', encoding='utf-8') as f:
transcription = f.read()
transcription_filename = os.path.basename(filepath)
print(f"Fichier lu: {len(transcription.split())} mots")
except Exception as e:
print(f"Erreur de lecture: {e}")
return
else:
print("Choix invalide")
return
if not transcription.strip():
print("Aucune transcription fournie")
return
print(f"\nAnalyse intelligente en cours...")
# Effectuer le matching intelligent
results = matcher.smart_match_transcription(transcription, transcription_filename, k=5)
# Afficher les résultats
matcher.print_smart_results(results)
# Afficher le meilleur match remplissable
best_fillable = matcher.get_best_fillable_match(transcription, transcription_filename)
if best_fillable:
print(f"\nMEILLEUR TEMPLATE REMPLISSABLE:")
print(f"{'='*60}")
print(f"Template: {best_fillable.template_id}")
print(f"Score global: {best_fillable.overall_score:.3f}")
print(f"Score nom de fichier: {best_fillable.filename_match_score:.3f}")
print(f"Indicateurs fichier: {', '.join(best_fillable.filename_indicators)}")
print(f"Capacité de remplissage: {best_fillable.filling_percentage:.1f}%")
print(f"Confiance: {best_fillable.confidence_level}")
if best_fillable.extracted_data:
print(f"\nTEMPLATE PRÊT À REMPLIR:")
print(f"Sections avec données extraites:")
for section, content in best_fillable.extracted_data.items():
print(f"\n[{section.upper()}]")
print(f"{content}")
# Proposer de voir plus de détails
show_details = input(f"\nAfficher les détails complets du template? (y/n): ").strip().lower()
if show_details == 'y':
matcher.parser.print_template_summary(best_fillable.template_id)
# Proposer de générer le template rempli
generate_filled = input(f"\nGénérer le template rempli? (y/n): ").strip().lower()
if generate_filled == 'y':
generate_filled_template(matcher, best_fillable, transcription)
else:
print(f"\nAucun template ne peut être suffisamment rempli avec cette transcription")
if results:
print(f"\nMeilleurs candidats (mais insuffisamment remplissables):")
for i, result in enumerate(results[:3], 1):
print(f"{i}. {result.template_id} - Score: {result.overall_score:.3f}")
print(f" Score fichier: {result.filename_match_score:.3f}")
print(f" Remplissage: {result.filling_percentage:.1f}%")
def generate_filled_template(matcher: SmartTranscriptionMatcher, best_match: TemplateMatch, transcription: str):
"""Génère un template rempli avec les données extraites"""
print(f"\nGÉNÉRATION DU TEMPLATE REMPLI")
print(f"{'='*80}")
try:
# Récupérer le contenu du template original
template_info = best_match.template_info
# Charger le contenu du fichier template
if os.path.exists(template_info.filepath):
with open(template_info.filepath, 'r', encoding='utf-8') as f:
template_content = f.read()
else:
print(f"Fichier template non trouvé: {template_info.filepath}")
return
filled_content = template_content
replacement_count = 0
# Remplacer les sections avec les données extraites
for section_name, extracted_content in best_match.extracted_data.items():
# Rechercher des patterns de remplacement dans le template
patterns = [
f"[{section_name.upper()}]",
f"[{section_name}]",
f"{{{section_name}}}",
f"__{section_name}__",
f"<!-- {section_name} -->",
f"_{section_name}_",
]
# Rechercher aussi par mots-clés de la section
section_keywords = section_name.lower().split()
for keyword in section_keywords:
patterns.extend([
f"[{keyword.upper()}]",
f"{{{keyword}}}",
f"__{keyword}__"
])
# Essayer de remplacer avec chaque pattern
for pattern in patterns:
if pattern in filled_content:
filled_content = filled_content.replace(pattern, extracted_content)
replacement_count += 1
print(f"Section '{section_name}' remplie ({pattern})")
break
else:
# Si aucun pattern trouvé, essayer de trouver la section par similarité
lines = filled_content.split('\n')
for i, line in enumerate(lines):
if any(keyword in line.lower() for keyword in section_keywords):
# Insérer le contenu après cette ligne
lines.insert(i + 1, f"\n{extracted_content}\n")
filled_content = '\n'.join(lines)
replacement_count += 1
print(f"Section '{section_name}' insérée après ligne similaire")
break
else:
print(f"Section '{section_name}' non intégrée - pattern non trouvé")
# Sauvegarder le template rempli
output_filename = f"template_rempli_{best_match.template_id}.txt"
try:
with open(output_filename, 'w', encoding='utf-8') as f:
f.write(filled_content)
print(f"\nTemplate rempli sauvegardé: {output_filename}")
except Exception as e:
print(f"Erreur lors de la sauvegarde: {e}")
# Proposer d'afficher un aperçu
show_preview = input(f"\nAfficher un aperçu du template rempli? (y/n): ").strip().lower()
if show_preview == 'y':
print(f"\n{'='*80}")
print(f"APERÇU DU TEMPLATE REMPLI")
print(f"{'='*80}")
# Afficher les premiers 2000 caractères
preview = filled_content[:2000]
if len(filled_content) > 2000:
preview += "\n\n[... Tronqué pour l'aperçu ...]"
print(preview)
print(f"\n{'='*80}")
except Exception as e:
print(f"Erreur lors de la génération: {e}")
logging.error(f"Erreur génération template: {e}")
def analyze_transcription_quality(transcription: str) -> Dict:
"""Analyse rapide de la qualité d'une transcription"""
words = transcription.split()
sentences = transcription.split('.')
# Métriques de qualité
metrics = {
"word_count": len(words),
"sentence_count": len([s for s in sentences if s.strip()]),
"avg_sentence_length": len(words) / max(len(sentences), 1),
"has_medical_terms": bool(re.search(r'\b(mm|cm|ml|IRM|scanner|échographie|résultats?|conclusion)\b', transcription.lower())),
"has_measurements": bool(re.search(r'\d+\s*(mm|cm|ml)', transcription)),
"has_sections": bool(re.search(r'\b(technique|résultats?|conclusion|indication)\b', transcription.lower())),
"structure_score": 0
}
# Calculer un score de structure
structure_indicators = ['technique', 'résultat', 'conclusion', 'indication', 'observation']
structure_count = sum(1 for indicator in structure_indicators if indicator in transcription.lower())
metrics["structure_score"] = min(1.0, structure_count / 3.0)
# Évaluation globale
if (metrics["word_count"] > 100 and
metrics["has_medical_terms"] and
metrics["has_sections"] and
metrics["structure_score"] > 0.5):
quality = "excellent"
elif (metrics["word_count"] > 50 and
metrics["has_medical_terms"] and
metrics["structure_score"] > 0.3):
quality = "good"
elif metrics["word_count"] > 20 and metrics["has_medical_terms"]:
quality = "fair"
else:
quality = "poor"
metrics["overall_quality"] = quality
return metrics
if __name__ == "__main__":
main() |