pipeline2 / main.py
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"""
main.py
Point d'entrée principal pour le système de matching hybride
"""
import os
import sys
import logging
from pathlib import Path
# Importer les modules
from template_db_creation import MedicalTemplateParser,TemplateInfo
from smart_match import TranscriptionMatcher
from title_matcher import HybridMatcher
# Configuration du logging
logging.basicConfig(
level=logging.INFO,
format='%(asctime)s - %(name)s - %(levelname)s - %(message)s'
)
logger = logging.getLogger(__name__)
def load_transcription_file(filepath: str) -> tuple:
"""
Charge une transcription depuis un fichier
Args:
filepath: Chemin vers le fichier
Returns:
tuple: (contenu, nom_fichier)
"""
try:
with open(filepath, 'r', encoding='utf-8') as f:
content = f.read()
filename = os.path.basename(filepath)
logger.info(f"✅ Transcription chargée: {filename}")
return content, filename
except Exception as e:
logger.error(f"❌ Erreur lecture fichier: {e}")
return None, None
def save_result(result, output_path: str):
"""
Sauvegarde le résultat dans un fichier
Args:
result: MatchResult à sauvegarder
output_path: Chemin du fichier de sortie
"""
try:
with open(output_path, 'w', encoding='utf-8') as f:
f.write("="*80 + "\n")
f.write(f"TEMPLATE: {result.template_id}\n")
f.write(f"MÉTHODE: {result.match_method}\n")
f.write(f"CONFIANCE: {result.confidence_score:.2%}\n")
f.write("="*80 + "\n\n")
f.write(result.filled_template)
logger.info(f"✅ Résultat sauvegardé: {output_path}")
except Exception as e:
logger.error(f"❌ Erreur sauvegarde: {e}")
def batch_process_directory(hybrid_matcher, input_dir: str, output_dir: str):
"""
Traite tous les fichiers d'un répertoire
Args:
hybrid_matcher: Instance de HybridMatcher
input_dir: Répertoire des transcriptions
output_dir: Répertoire de sortie
"""
# Créer le répertoire de sortie
os.makedirs(output_dir, exist_ok=True)
# Lister les fichiers
input_path = Path(input_dir)
transcription_files = list(input_path.glob("*.txt")) + list(input_path.glob("*.rtf"))
logger.info(f"\n{'='*80}")
logger.info(f"📁 TRAITEMENT PAR LOT - {len(transcription_files)} fichiers")
logger.info(f"{'='*80}\n")
results_summary = []
for i, filepath in enumerate(transcription_files, 1):
logger.info(f"\n{'─'*80}")
logger.info(f"📄 Fichier {i}/{len(transcription_files)}: {filepath.name}")
logger.info(f"{'─'*80}")
# Charger la transcription
content, filename = load_transcription_file(str(filepath))
if not content:
continue
# Matcher et remplir
results = hybrid_matcher.match_and_fill(
transcription=content,
transcription_filename=filename
)
if results:
result = results[0]
# Sauvegarder
output_filename = f"{filepath.stem}_filled.txt"
output_path = os.path.join(output_dir, output_filename)
save_result(result, output_path)
# Ajouter au résumé
results_summary.append({
'filename': filename,
'template': result.template_id,
'method': result.match_method,
'confidence': result.confidence_score
})
else:
logger.warning(f"⚠️ Aucun résultat pour {filename}")
results_summary.append({
'filename': filename,
'template': 'NONE',
'method': 'FAILED',
'confidence': 0.0
})
# Afficher le résumé
print("\n" + "="*80)
print("📊 RÉSUMÉ DU TRAITEMENT PAR LOT")
print("="*80)
for item in results_summary:
print(f"📄 {item['filename']}")
print(f" → Template: {item['template']}")
print(f" → Méthode: {item['method']}")
print(f" → Confiance: {item['confidence']:.2%}")
print()
def interactive_mode(hybrid_matcher):
"""
Mode interactif pour traiter les transcriptions
Args:
hybrid_matcher: Instance de HybridMatcher
"""
# Exemple de transcription
transcription_example = """
IRM pelvienne. Indication clinique. Technique. Acquisition sagittale, axiale et coronale T2, saturation axiale, diffusion axiale T1. Résultats. Présence d'un utérus antéversé médio-pelvien dont le grand axe mesure 72 mm sur 40 mm sur 40 mm. La zone jonctionnelle apparaît floue. Elle est épaissie de façon diffuse, asymétrique, avec une atteinte de plus de 50% de l'épaisseur du myomètre et comporte des spots en hypersignal T2, l'ensemble traduisant une adénomyose.
Pas d'épaississement cervical. À noter la présence d'un petit kyste liquidien de type Naboth.
Les 2 ovaires sont repérés, porteurs de formations folliculaires communes en hypersignal homogène T2 de petite taille. L'ovaire droit mesure 30 x 25 mm. L'ovaire gauche mesure 25 x 23 mm. Pas d'épanchement dans le cul-de-sac de Douglas.
Absence de foyer d'endométriose profonde. Conclusion.
Aspect d'adénomyose diffuse, symétrique, profonde.
Pas d'épaississement endométrial. Absence d'endométriome. Absence d'épanchement dans le cul-de-sac de Douglas.
"""
while True:
print("\n" + "="*80)
print("🔧 MODE INTERACTIF - OPTIONS")
print("="*80)
print("1. Charger une transcription depuis un fichier (avec matching par titre)")
print("2. Entrer une transcription manuellement (matching sémantique uniquement)")
print("3. Utiliser l'exemple de transcription (matching sémantique)")
print("4. Traitement par lot d'un répertoire")
print("5. Quitter")
print("="*80)
choice = input("\n👉 Votre choix: ").strip()
if choice == "1":
# Charger depuis un fichier
filepath = input("📂 Chemin du fichier de transcription: ").strip()
if not os.path.exists(filepath):
print(f"❌ Fichier introuvable: {filepath}")
continue
content, filename = load_transcription_file(filepath)
if not content:
continue
# Matching hybride (avec titre)
results = hybrid_matcher.match_and_fill(
transcription=content,
transcription_filename=filename
)
elif choice == "2":
# Saisie manuelle
print("\n📝 Entrez la transcription (Ctrl+D ou Ctrl+Z pour terminer):")
lines = []
try:
while True:
line = input()
lines.append(line)
except EOFError:
pass
content = "\n".join(lines)
if not content.strip():
print("❌ Transcription vide")
continue
# Matching sémantique uniquement
results = hybrid_matcher.match_and_fill(
transcription=content,
transcription_filename=None
)
elif choice == "3":
# Exemple
content = transcription_example
# Matching sémantique uniquement
results = hybrid_matcher.match_and_fill(
transcription=content,
transcription_filename=None
)
elif choice == "4":
# Traitement par lot
input_dir = input("📂 Répertoire des transcriptions: ").strip()
if not os.path.exists(input_dir):
print(f"❌ Répertoire introuvable: {input_dir}")
continue
output_dir = input("📂 Répertoire de sortie: ").strip()
batch_process_directory(hybrid_matcher, input_dir, output_dir)
continue
elif choice == "5":
print("\n👋 Au revoir!")
break
else:
print("❌ Choix invalide")
continue
# Afficher les résultats
if results:
for i, result in enumerate(results, 1):
print(f"\n{'#'*80}")
print(f"# RÉSULTAT {i}/{len(results)}")
print(f"{'#'*80}")
hybrid_matcher.semantic_matcher.display_result(result)
# Proposer de sauvegarder
save_choice = input("\n💾 Sauvegarder le résultat? (o/n): ").strip().lower()
if save_choice == 'o':
output_file = input("📄 Nom du fichier de sortie: ").strip()
if output_file:
save_result(results[0], output_file)
else:
print("❌ Aucun résultat trouvé")
def main():
"""
Fonction principale
"""
print("\n" + "="*80)
print("🏥 SYSTÈME DE MATCHING HYBRIDE DE TEMPLATES MÉDICAUX")
print("="*80)
print("Version 2.0 - Matching par titre + Matching sémantique")
print("="*80 + "\n")
# Étape 1: Charger la base de données
db_path = input("📂 Chemin vers la base de données (.pkl): ").strip()
if not os.path.exists(db_path):
print(f"❌ Fichier introuvable: {db_path}")
return
print("\n🔄 Chargement de la base de données...")
parser = MedicalTemplateParser()
try:
parser.load_database(db_path)
print(f"✅ Base chargée: {len(parser.templates)} templates disponibles")
except Exception as e:
print(f"❌ Erreur lors du chargement: {e}")
return
# Étape 2: Initialiser les matchers
print("\n🔄 Initialisation des matchers...")
try:
semantic_matcher = TranscriptionMatcher(parser)
print("✅ Matcher sémantique initialisé")
hybrid_matcher = HybridMatcher(parser, semantic_matcher)
print("✅ Matcher hybride initialisé")
except Exception as e:
print(f"❌ Erreur lors de l'initialisation: {e}")
return
# Étape 3: Vérifier la disponibilité de GPT
if not semantic_matcher.llm:
print("\n⚠️ ATTENTION: GPT n'est pas disponible")
print("⚠️ Vérifiez que OPENAI_API_KEY est définie")
print("⚠️ Le remplissage sera basique")
continue_choice = input("\nContinuer quand même? (o/n): ").strip().lower()
if continue_choice != 'o':
return
# Étape 4: Afficher les statistiques
print("\n" + "="*80)
print("📊 STATISTIQUES DE LA BASE")
print("="*80)
# Compter les types de templates
types_count = {}
for template_id, template_info in parser.templates.items():
template_type = template_info.type
types_count[template_type] = types_count.get(template_type, 0) + 1
print(f"📋 Total de templates: {len(parser.templates)}")
print("\n📑 Répartition par type:")
for template_type, count in sorted(types_count.items(), key=lambda x: x[1], reverse=True):
print(f" • {template_type}: {count}")
print("="*80)
# Étape 5: Choisir le mode
print("\n" + "="*80)
print("🔧 MODE DE FONCTIONNEMENT")
print("="*80)
print("1. Mode interactif (traiter des transcriptions une par une)")
print("2. Traitement par lot (traiter un répertoire entier)")
print("3. Quitter")
print("="*80)
mode_choice = input("\n👉 Votre choix: ").strip()
if mode_choice == "1":
interactive_mode(hybrid_matcher)
elif mode_choice == "2":
input_dir = input("\n📂 Répertoire des transcriptions: ").strip()
if not os.path.exists(input_dir):
print(f"❌ Répertoire introuvable: {input_dir}")
return
output_dir = input("📂 Répertoire de sortie: ").strip()
batch_process_directory(hybrid_matcher, input_dir, output_dir)
elif mode_choice == "3":
print("\n👋 Au revoir!")
else:
print("❌ Choix invalide")
if __name__ == "__main__":
try:
main()
except KeyboardInterrupt:
print("\n\n👋 Interruption par l'utilisateur. Au revoir!")
sys.exit(0)
except Exception as e:
logger.error(f"❌ Erreur fatale: {e}", exc_info=True)
sys.exit(1)